Prusia fue aplastada en un solo día, el 14 de octubre de 1806, en Jena y Auerstedt. El 27 de octubre Napoleón entró en Berlín por la puerta de Brandeburgo, a la cabeza de la Guardia, ante una población silenciosa. El ejército de Federico el Grande, reputado el mejor de Europa, había dejado de existir en tres semanas.
Los gestos que siguieron estaban calculados para humillar. La cuadriga de la puerta de Brandeburgo fue desmontada y enviada a París; nunca se instaló allí y volvió en 1814. En Potsdam hizo abrir la tumba de Federico II, se recogió ante el ataúd y mandó a los Inválidos la espada, la banda y las banderas del gran rey. A Prusia se le tomaron las reliquias antes que las provincias.
El 21 de noviembre de 1806 firmó el decreto de Berlín. Incapaz de vencer a la marina británica, decretó el bloqueo de las islas Británicas: todo comercio, toda correspondencia, toda mercancía inglesa quedaban prohibidos en el continente. Es el viraje económico del reinado — y la causa de casi todas las guerras siguientes, de Portugal a Rusia.
La ocupación, las contribuciones de guerra y el desmembramiento de 1807 produjeron el efecto contrario al buscado. Fichte pronunció en Berlín, en 1807-1808, sus Discursos a la nación alemana; la universidad de Berlín fue fundada en 1810 por Humboldt; Stein y Hardenberg reformaron el Estado, Scharnhorst el ejército. La capital humillada estaba fabricando la revancha de 1813.
