La Prussia fu schiacciata in un solo giorno, il 14 ottobre 1806, a Jena e Auerstedt. Il 27 ottobre Napoleone entrò a Berlino dalla porta di Brandeburgo, alla testa della Guardia, davanti a una popolazione silenziosa. L'esercito di Federico il Grande, reputato il migliore d'Europa, aveva cessato di esistere in tre settimane.
I gesti che seguirono erano calcolati per umiliare. La quadriga della porta di Brandeburgo fu smontata e spedita a Parigi; non vi fu mai installata e tornò nel 1814. A Potsdam fece aprire la tomba di Federico II, si raccolse davanti alla bara e fece inviare agli Invalides la spada, la sciarpa e le bandiere del grande re. Alla Prussia si tolsero le reliquie prima delle province.
Il 21 novembre 1806 firmò il decreto di Berlino. Non potendo battere la marina britannica, decretò il blocco delle isole Britanniche: ogni commercio, ogni corrispondenza, ogni merce inglese erano vietati sul continente. È la svolta economica del regno — e la causa di quasi tutte le guerre successive, dal Portogallo alla Russia.
L'occupazione, le contribuzioni di guerra e lo smembramento del 1807 produssero l'effetto opposto a quello cercato. Fichte pronunciò a Berlino, nel 1807-1808, i suoi Discorsi alla nazione tedesca; l'università di Berlino fu fondata nel 1810 da Humboldt; Stein e Hardenberg riformarono lo Stato, Scharnhorst l'esercito. La capitale umiliata stava fabbricando la rivincita del 1813.