Am 4. Mai 1814 landete er in dem von Cosimo de' Medici befestigten Hafen, zwischen zwei Festungen des 16. Jahrhunderts. Der Vertrag von Fontainebleau hatte ihm die volle Souveränität über die Insel gelassen, den Kaisertitel und eine Rente, die Ludwig XVIII. nie zahlen sollte. Binnen Tagen wählte er eine Flagge — weiß mit rotem Diagonalband und drei Bienen — und begann zu regieren.
Er regierte wirklich, und viel. Straßen, ein Spital, Beleuchtung, Kataster, eine Schule, Maulbeer- und Weinpflanzungen, Neuordnung der Eisenminen von Rio, Regelung des Thunfischfangs: In dreihundert Tagen wandte er auf zweiundzwanzigtausend Menschen Methoden an, die für vierzig Millionen gedacht waren. Die Elbaner behalten ihn eher in guter Erinnerung.
Zwei Residenzen sind erhalten, beide in Nationalmuseen verwandelt. Die Villa dei Mulini zwischen den beiden Forts überblickt das Meer: das Stadthaus, mit seiner Bibliothek von zweitausend aus Fontainebleau mitgebrachten Bänden. Die Villa San Martino, fünf Kilometer im Landesinneren, diente als Sommersitz; ihr ägyptischer Saal erinnert an 1798.
Die Abreise wurde im Hafen selbst vorbereitet. In der Nacht des 26. Februar 1815 lief die in englischen Farben übermalte Inconstant mit tausend Mann aus, während der britische Kommissar nicht auf der Insel war. Drei Tage später landete er in Golfe-Juan. Portoferraio ist der einzige Ort der Welt, an dem Napoleon Souverän war, ohne Eroberung und ohne Krieg.